Futaba y su ambiguo amigo Makoto se trasladan a Tokio, el epicentro de la invasión, para empezar la universidad. Allí conocen a Kadode, Ouran y compañía, quienes intentarán —a su manera— adaptarse a la vida universitaria y llevar cada una a su modo su particular cruzada en contra (o a favor) de los “invasores”.