La organización GORGOM cree en la evolución de las especies y pretenden forzar la evolución humana con su ingeniería genética.Para que sus seres mutantes puedan ser la raza dominante, es necesario exterminar a la humanidad ya que es considerada obsoleta. Kôtaro, personificado en Kamen Rider Black, decide utilizar todo su poder contra este malvado plan.