¡La batalla en contra de Medusa y sus secuaces continúa! Kid, Maka y Soul siguen luchando para evitar que sea despertada la maligna criatura que Shinigamisama resguarda debajo de Shibusen. Pero Maka sufrirá una transformación inesperada: ¡será dominada por una fuerza similar a la que domina el alma de Crona! Deberá aprovechar ese momento para acercarse a Crona; mientras que Kid y Black?Star enfrentarán las trampas del kishin.