El fracaso del Cuarto Niño ha supuesto un duro golpe para NERV y todos los que confían en ellos para proteger la ciudad, y a toda la humanidad, del ataque de esos seres monstruosos. Pero Kaji va descubriendo que los ataques de los Ángeles no son tan aleatorios o indiscriminados como parece, que en realidad lo que pretenden es una operación de rescate…