El ángel fue derrotado, pero después de la crisis hay que volver a la vida cotidiana y los héroes no siempre son salvadores para todas las personas. Sin embargo, ante el ataque de otro ángel las amistades pueden aparecer inesperadamente, fortalecerse o tensarse y romperse. Bajo el dudoso honor de pilotar una unidad Evangelion, una persona tan insegura como Shinji aprenderá que huir y alejarse de la personas no deja de afectarlas.